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2020-11-01 day 3 郑小西学习笔记

2020-11-01 day 3 郑小西学习笔记

作者: 呆呱呱 | 来源:发表于2020-11-01 14:27 被阅读0次

    linux 环境下的软件安装

    • wget
      用到wget命令

    wget 刚才复制的下载链接,如下图


    image.png

    wget功能

    wget是一个下载文件的工具,它用在命令行下。对于Linux用户是必不可少的工具,我们经常要下载一些软件或从远程服务器恢复备份到本地服务器。
    wget支持HTTP,HTTPS和FTP协议,可以使用HTTP代理。所谓的自动下载是指,wget可以在用户退出系统的之后在后台执行。这意味这你可以登录系统,启动一个wget下载任务,然后退出系统,wget将在后台执行直到任务完成

    「for Windows」请记住这里的粘贴不是ctrl+c和ctrl+V了,选中,鼠标左键点一下是复制,右键点一下是粘贴;
    「for Mac」直接cmd + c 复制,cmd + v粘贴
    sh是脚本(就是一个程序,后台的代码)文件的后缀,也就是说其实这是一个下载的脚本,如果你安装失败了,这个脚本是不需要重新下载的,还是可以用的。

    下载完成后进行安装
    bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

    bash的含义

    bash

    bash命令是sh命令的超集,大多数sh脚本都可以在bash下运行,bash主要有如下这些功能

    bash功能

    • 记录历史命令:bash可以记录曾经的命令,保持在~/.bash_history件中,只保存上次注销登录之后的命令
    • tab键自动补全:使用tab见可以自动不全命令或者目录i
    • alias命令别名:可以使用alias ll='ls -al'来设置命令的别名
    • 工作控制:可以将某些任务放在后台去运行,这里不多种介绍
    • 程序脚本:可以执行shell脚本文件
    • 通配符:在查找相关文件或者执行相关命令时,可以使用通配符*
    • 内建命令type:可以使用type 命令来查看某个命令是否为内建在bash当中的命令
    • source ~/.bashrc来激活conda

    • 使用conda

    1. 查看当前服务器上安装的所有软件列表· conda list

    image.png

    2. 搜索conda软件 conda search fastqc

    3. 安装软件 conda install fastqc -y

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