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晶体学信息文件CIF

晶体学信息文件CIF

作者: 汲之郎 | 来源:发表于2023-09-24 07:43 被阅读0次

    晶体学信息文件(Crystallographic Information File, CIF)是一种用于存储和交换晶体结构数据的标准文件格式,它由国际晶体学联合会(IUCr)制定和维护,广泛应用于晶体学、材料科学、化学、物理、生物等领域。CIF文件的扩展名为“.cif”,它是一种文本文件,可以用普通的文本编辑器打开和编辑,也可以用专门的晶体学软件进行处理和分析。

    CIF文件的内容主要包括以下几个方面:

    • 文件头部:包含了文件的来源、版本、日期、作者、引用等元数据,以及一些全局的设置和定义。

    • 数据块:包含了一个或多个晶体结构的具体数据,每个数据块以“data_”开头,后面跟着一个唯一的标识符。数据块中的数据可以分为两类:标签和值。标签是以“_”开头的预定义或自定义的关键字,用于描述数据的含义;值是与标签对应的具体的数据,可以是数字、字符串、表达式等。标签和值之间用空格或制表符分隔。数据块中还可以包含注释、循环、保存等其他元素。

    • 文件尾部:可以为空,也可以包含一些全局的设置和定义。

    CIF文件中存储的晶体结构数据主要包括以下几个方面:
    • 晶体化学信息:包括化学式、化合物名称、矿物名称、相名称等。
    • 晶胞参数:包括晶胞边长(a, b, c)、晶胞夹角(α, β, γ)、晶胞体积(V)、晶胞对称性(空间群)等。
    • 原子坐标:包括原子标签、原子类型、原子位置(x, y, z)、原子占位率、原子热振动参数等。
    • 结构因子:包括散射向量(Q)、结构因子幅值(F)、结构因子相位(φ)等。
    • 精修信息:包括精修方法、精修参数、精修结果(R因子等)、精修软件等。
    • 文献信息:包括文献标题、作者、杂志、年份、卷号、页码、DOI等。

    CIF文件的获取方法有多种,主要有以下几种:
    • 晶体学数据库:利用各种免费或收费的晶体学数据库进行检索和下载,如COD 、ICSD、CCDC等。
    • 文献附件:查找发表了晶体结构数据的文献,并从其附件或补充材料中下载CIF文件。
    • 晶体学软件:利用各种晶体学软件进行晶体结构绘制或精修,并导出CIF文件,如Vesta、Fullprof、GSAS等。
    • 理论计算:利用各种理论计算软件进行晶体结构预测或模拟,并导出CIF文件,如Materials Project、Materials Studio等。

    以上是我对晶体学信息文件CIF的介绍,希望对你有所帮助。

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