从NCBI 下载SRA文件

从NCBI上下载sra文件，可使用wget

• 进入NCBI

• 选取下载文件链接

  
  

• 导出下载链接

红色框就是下载链接

使用一个循环进行下载即可

• 将sra变为fastq

使用fastq-dump，从http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?cmd=show&f=software&m=software&s=software
下载相应软件

wget https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.10.8/sratoolkit.2.10.8-ubuntu64.tar.gz
tar -xf sratoolkit.2.10.8-centos_linux64.tar

## 检测
bin/fasterq-dump -h

# single-end
fastq-dump test.sra

# pair-end
fastq-dump --split-3 test.sra