从NCBI上下载sra文件，可使用wget
选取下载文件链接
导出下载链接
红色框就是下载链接
使用一个循环进行下载即可
使用fastq-dump，从http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?cmd=show&f=software&m=software&s=software
下载相应软件
wget https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.10.8/sratoolkit.2.10.8-ubuntu64.tar.gz
tar -xf sratoolkit.2.10.8-centos_linux64.tar
## 检测
bin/fasterq-dump -h
# single-end
fastq-dump test.sra
# pair-end
fastq-dump --split-3 test.sra
除了利用ascp命令从NCBI下载SRA文件外，SRAtoolkit也提供了prefetch命令用于下载SRA文件...
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本文标题：从NCBI 下载SRA文件
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/lrtzektx.html
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