06.如何选取数据集

作者: 大肥口水垫 | 来源:发表于2019-06-03 22:21 被阅读0次

选取什么样的变异位点？

name	111	222	333	444
aaa	bbb	ccc	ddd	eee
fff	ggg	hhh	iii	000

根据项目的目的，我们需要探索的其实是SNP之间的关联，落在什么通路上。

Hugo_Symbol     Entrez_Gene_Id  Center  NCBI_Build      Chromosome      Start_Position  End_Position    Strand  Variant_Classification  Variant_Type
TEKT4   150483  BI      GRCh38  chr2    94876716        94876716        +       Missense_Mutation       SNP     A       A       G
TKTL2   84076   BI      GRCh38  chr4    163473615       163473615       +       Silent  SNP     C       C       T 
MIR8078 102466878       BI      GRCh38  chr18   109358  109358  +       3'Flank SNP     T       T       C
FLT3    2322    BI      GRCh38  chr13   28028203        28028203        +       Missense_Mutation       SNP     G       G       T  
TMEM119 338773  BI      GRCh38  chr12   108592157       108592157       +       Frame_Shift_Del DEL     C       C       -