「Primer Check」支持「多态性」引物筛选了~~

写在前面

至此，「TBtools」中「分子辅助育种」相关的功能释放 30% 了。第一阶段结束。余下功能，预计等暑期慢慢释放。「功能开发」的难度。作为阶段结束推文，相对简单，是「Primer Check」插件的升级简要说明。
前述，「Primer Check」做了两次升级：

1. 引物特异性检测
2. 与「e-GelImage」结合，开发成有电泳图的引物特异性检测

可以发现，都是针对引物特异性检测的。但事实上，在「分子标记」开发工作中，我们常常需要的是检测引物在多个材料中的「多态性」而不是纯粹的在一个样品中的特异性。

升级版「Primer Check」

于是，简单修改了一下逻辑，用户只需要选取指定的多个Primer Check Database 就可以开展引物多态性检验。大体如下，

输出结果如下

可以看到，第一对引物在 93-11 和 IR64 中存在片段大小变化，而Nip和93-11中大小一致；第二对引物同样 93-11 和 IR64 中存在片段大小变化，但在Nip中没有有效扩增片段（或者是引物无法正常结合；或者是有大的插入片段......）。当然，这很合理，因为这个位点，我们是基于 93-11 和 IR64 的基因组比对获得的。

写在最后

今天是假期第一天。就写这么多了。