1.组装 小基因组比如细菌的（不到10M）可以直接用HGAP3。直接在网页版跑，（<100M)都可以。 端口配置。...
了解物种详细名称，具体分析内容。 0.prodigal 注意多个contig的genomecds和pep：的loc...
长读长组装发展 2012：三代组装、二代校正；耗资源，适合小基因组，如细菌，4-15%错误率 2013：三代组装、...
功能注释 需要faa蛋白序列，prodigal的pep就是蛋白序列 1.BLAST数据库注释 1. blast 需...
1.conda安装 直接安装 2.手动安装 2.1 Celera assembler 界面似乎提醒已经停止更新，如...
1. Spades 细菌基因组组装最佳软件(主观感受)，可进行二代组装，三代组装以及二代三代混合组装。 2. U...
【原创】在NCBI查找指定物种基因组信息 生信分析中经常需要查找指定物种的基因组信息。如：基因组相关分析中需要借助...
细菌基因组组装金标准：GAGE-B 组装软件的选择 细菌基因组组装的目标不同于大型生物基因组的组装，大型基因组组装...
甲基化修饰 甲基化分析结果（直接从服务器下载，文件名乱码）/opt/pacbio_soft/smrtanalysi...
前言：仍然是三代测序数据的分析，宏基因组的文章中经常出现聚类热图和物种丰度图，用来直观地识别与某些疾病或者表型相关...
本文标题：分析记录|三代细菌基因组理论相关
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/lwrrpxtx.html
网友评论