02 概述图

作者: BenThomson | 来源:发表于2019-01-17 10:48 被阅读6次

原文:Points of view: The overview figure

我们写研究论文的目的是尽可能清楚地传达信息。在过去的专栏中,我提出了几种图形设计技巧,以提高图形(传达信息的)清晰度。除了精炼基于数据的图形之外,还包括研究论文中的概述图,它们为读者提供了一个理解实验设计和研究中所发现的框架。

概述图中说明式图例可使出版物普及到更多的读者。它们为数据提供了上下文概要。像这样的图我举一个例子说明(图一1。它描述了被称为 Hi-C 的技术,用于确定细胞如何组织管理数十亿个 DNA 对。首张图形(传达信息)是有效的,因为它构建了(合理的)心理模型以理解技术,并(以满足)主要的读者所期望得DNA序列信息作为主要数据类型。

典型的概述图说明了一个过程(图一)或比较不同条件,如「控制组」和「实验组」(图二2。这些图形把一个连续的过程描绘成不连续的步骤。 因此,我们必须通过图像和书面描述来(弥补)创造连续性。通过将其与前一步骤和后一步骤相关联来理解进展中的每个步骤。 为了进行比较,还应强调各过程之间相应步骤的差异(图二)。

在程序框图的设计中,采用「A 到 B」结构是有用的,其中 A 和 B 是通过操作连接的(不同)状态。通常以图形方式描绘状态,以文字方式描述动作叙述从A到B的转化(例如,用限制性内切酶切割)。若要在步骤之间创建良好的视觉链接,请重绘上一步的元素,且仅突出显示有效的更改。因为读者需要跟踪一系列事件,所以考虑从图中引入和移除的所有图形元素需是(对理解)有帮助的。当元素的数量从一个步骤到下一个步骤不匹配时,可能会混淆读者并减弱概述图的效用。

在视觉交流中,符号具有最小的重叠意义是很重要的。例如,可以使用箭头来指向和指示运动。当相同的图形用于表示不同的事物时,它妨碍信息有效、准确地解码。在图2的设计中,我使用箭头来指示进程和领导者虚线——没有箭头的线条——来标记。在图一中,我使用箭头来指示测序引物的方向性。清晰的意义描述使读者能够快速地学习视觉词汇并将信息分组到层次结构中。同样,使用语言使读者更容易理解词语描述的故事。不同的句子结构可以用来描述操作,或用来标记对象(即,「用限制酶切割」和「限制片段」)。

尽管它们普遍有用,但是当空间变得有限时,概述图形通常是首先被剔除的。将它们包括在最终出版物中的一个策略是设计具有实用性标记的插图,并使它们尽可能紧凑。我设计了 Hi-C 的概述图(图一)没有插入箭头,使用动作标签作为标题以节省空间。水平布局提供了一个自然的从左到右的排序。通过充分利用可用的空白空间3并根据格式塔原理将视觉元素组织成组,可以实现高效的空间设计4,5

图一

概述图可以阐明概念。概述 Hi-C 技术是用于破解人类基因组的三维结构的。 转载自参考文献1

图二

有序的组合和清晰的视觉编码使图表更容易理解。 图表比较了筛选富集干扰 RNA 的实验条件。 转载自参考文献2

参考文献

  1. Lieberman-Aiden, e. et al. Science 326, 289–293 (2009).
  2. Luo, B. et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105, 20380–20385
    (2008).
  3. wong, B. Nat. Methods 8, 5 (2011).
  4. wong, B. Nat. Methods 7, 863 (2010).
  5. wong, B. Nat. Methods 7, 941 (2010).

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