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Circos-Windows实战笔记（楔子）

Circos-Windows实战笔记（楔子）

作者: liu_ll | 来源:发表于2018-10-30 18:56 被阅读15次

最近看了一篇文章，主要讲的是一对同卵双胞胎，一个患了白血病一个没有患白血病，然后对其进行了全基因组（WGS）分析，发现MLL-NRIP3融合基因以及SETD2（编码H3K36甲基转移酶）的双等位突变。进而从表观的角度阐述SETD2-H3K36me3通路在肿瘤通路上的作用。

图一、二：文章的标题和摘要

然鹅，看到第一个Circos图的时候蒙圈半天，让我萌生了想好好学习一波的想法。

图三：Circos图，红框中显示了融合基因MLL-NRIP3

首先，我们需要搞清楚，这个Circos图到底说了什么内容！从文献的图注来看，鉴定了SNV,CNV等，然后发现了融合了基因。但是确实有点疑惑的是，到底哪一圈是SNV,CNV呢？

图四：Cricos的图注解释

抱着打破砂锅问到底的心态，我开始了我的Circos学习之旅！

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