单细胞5端测序就是再在每一个单独的GEM里,除了 Gel Bead表面携带的Barcode和UMI所在的核酸序列,还有游离的poly-dT作为引物来结合RNA 3'端 poly(A)尾巴来扩增得到全长cDNA。
image.png因此5端最重要的其实就是这个游离的dT以及能够催化从dT延申到GGG的酶,这也是3端不需要的
image.png最终产生的序列文库都不一样
What is the difference between Single Cell 3' and 5’ Gene Expression libraries? – 10X Genomics
[单细胞免疫组库测序建库原理图解 - 知乎 (zhihu.com)]
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