首先查看samtools view的帮助,发现可以选择比对区域
Usage: samtools view [options] <in.bam>|<in.sam>|<in.cram> [region ...]
查看samtools版本为
~/Ebola/code/bam# conda list | grep samtools
samtools 1.10 h9402c20_2 https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
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