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有参转录组实战11-上传转录组到NCBI

有参转录组实战11-上传转录组到NCBI

作者: 啊辉的科研 | 来源:发表于2024-05-10 12:15 被阅读0次

登录NCBI>点击submit>选SRA>选Project>点New submission

1 SUBMITTER

填写名字,邮件,no group,学校学院,街道邮编国家,continue

2 GENERAL INFO

填no BioProject, no BioSample,立马释放数据。

3 PROJECT INFO

填个title和description,no

4 BIOSAMPLE TYPE,填PLANT

5 BIOSAMPLE ATTRIBUTES,Use built-in table editor

开始填表,sample name命名不要相似,组间要有明显的区别,自己加一列replicate

6,SRA METADARA

use built-in table editor

6.5,安装aspera看百度

7,file

选FTP or aspera command line file preload

点开aspera command line upload instructions,下载key file,到服务器里面,一个新的文件夹里面只放我的转录组数据,注意转录组的名字要和上图完全一样。

7.1,等一段较长的时间上传完毕后,在网页上选select preload folder,选择上传好的文件夹

7.2,最后勾选Autofinish submission,continue

8,收到邮箱信息,说等审核过了就自动释放数据了,等两天吧。之后在manage data里面可以看到工程号、样本号和SRA号了。

最后一个转录组教程了,完结。

#万神殿

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