有参转录组：针对有参考基因组序列的物种进行 mRNA 的分析。
无参转录组：针对尚无参考基因组序列发布的物种进行 mRNA 的分析。
DGE：数字基因表达谱。需要提供参考基因组/组装转录组序列，分析内容较转录组少，主要进行差异分析及富集分析。
small RNA：对长度在 18-40bp 的短 RNA 进行序列、结构、表达、功能上的分析，主要进行 miRNA，siRNA，piRNA 几种类型 sRNA 的分析；可与 mRNA 关联分析。
lncRNA：对长度大于 200bp 的非编码 RNA 进行鉴定、表达、功能等上的分析，可与 mRNA 关联分析。
dRNA-seq：differencial RNA sequencing，其在实验时采用了 5’单磷酸依赖的外切酶, 可以特异性地降解加工过的转录本, 从而使初始转录本得到富集, 已被广泛应用到原核生物转录起始位点、小的调控RNA、启动子及操纵子等研究中。
有参转录组分析流程
无参转录组分析流程
（十）、分析流程及软件列表 有参转录组：针对有参考基因组序列的物种进行 mRNA 的分析。 无参转录组：针对尚无参...
各种测序基础知识介绍 RNA-Seq名词解释 index 测序的标签，用于测定混合样本，通过每个样本添加的不同标签...
8种特殊建库测序 8种特殊建库测序 1. RNA-seq 2. 外显子测序 3. small RNA-seq 4....
三、建库测序相关： library construction：文库构建，高通量测序前准备步骤。针对不同的研究目的建...
一、基本概念 RNA-seq即转录组测序[https://baike.baidu.com/item/%E8%BD%...
四、拼接相关名词解释 assembly：组装/拼接，为得到原始序列，依据重叠关系将段片段融合成长序列的过程。 N5...
(五)比对相关 blast：Basic Local Alignment Search Tool，一种序列比对的工具...
（九）、分析内容相关 gene annotation：基因注释，分为基因的结构注释和基因的功能注释。 CDS pr...
（七）分子标记相关 分子标记：是遗传标记的一种，直接在 DNA 分子上检测遗传变异。分子标记能对不同发育时期的个体...
（八）比较转录组学相关 比较转录组学：（Comparative Transcriptomics）是一种快速、全面解...
本文标题：RNA-seq名词解释（8）
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/djviurtx.html
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