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2bit文件转换为fa格式文件 2019-10-22

2bit文件转换为fa格式文件 2019-10-22

作者: 夸克光子 | 来源:发表于2019-10-22 09:35 被阅读0次

    处理数据时,需用到小鼠的基因组,于是在UCSC上面下载了小鼠的mm10基因组,但是是2bit格式,无fa文件,

    不过说明中有提到2bit转换fa的方法,具体如下:

    1、下载mm10.2bit文件

    2、mm10.2bit 文件说明提到方法(如下),可以打开链接 http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/

    3、之后下拉页面找到 twoBitToFa 文件下载

    4、下载之后文件所在目录下直接终端输入命令:/home/wangyahao/文档/twoBitToFa mm10.2bit mm10.fa

    ‘ /home/wangyahao/文档 ’ 为 twoBitToFa 文件的所在路径

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