建立Hisat2要求格式的reference
hisat2-build -p 4 genome.fa --snp genome.snp --ss genome.ss --exon genome.exon output.ref
-p : 线程数
--snp : SNP文件路径和文件名，可省略
--ss : Splice Site文件路径和文件名
--exon : 外显子文件路径和文件名
Index.png
生成的八个ht2文件共同构成了同一个Index，不可分开使用
hisat2-build -p 4 genome.fa --snp genome.snp --ss genome.ss --exon genome.exon output.ref
-p : 线程数
--snp : SNP文件路径和文件名，可省略
--ss : Splice Site文件路径和文件名
--exon : 外显子文件路径和文件名
Index.png
生成的八个ht2文件共同构成了同一个Index，不可分开使用
本文标题：hisat2: 建立reference
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