为了满足科研同伴绘制基因组类型circos图的需求，联川生物近期推出了circos云工具，功能强大，操作简单，接下来将以下图为例，教大家如何使用circos云工具绘制一张高颜值circos图。

和弦图类型的circos图绘制教程请见：如何绘制Cirocs和弦图？ | OmicStudio

文中图片绘制所用的示例数据，可以在文末找到下载地址。

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1.打开云工具

首先打开联川生物云平台circos云工具（如上图标），选择circos绘图-基因组类型。

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2.绘制基因组框架

选择不使用示例数据，上传基因组表格（示例数据：genome_info.xlsx），点击开始绘图。

可以选择给染色图标记颜色，或在框架上标记基因。

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3.绘制和弦图（可选）

选择绘制和弦图，上传和弦图表格（示例数据：circos_link.xlsx），点击开始绘图。

可以修改配色方案。

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4.绘制环形图（可选）

选择绘制环形图，设置需要绘制的环个数，逐圈选择每个环的绘图类型并上传相应表格，点击开始绘图。

上图的具体参数如下：圈圈个数：6

第1圈（绘图类型：热图 ；上传文件：heatmap.xlsx）

第2圈（绘图类型：点状+高度 ；上传文件：point_h.xlsx）

第3圈（绘图类型：柱形+高度 ；上传文件：barplot.xlsx）

第4圈（绘图类型：区域+高度 ；上传文件：region_h.xlsx）

第5圈（绘图类型：线条+位置 ；上传文件：line_pos.xlsx）

第6圈（绘图类型：区域+申请 ；上传文件：region_c.xlsx）

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5.组合绘图

同时勾选绘制环形图和和弦图，并适当调整配色方案。

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6.图片下载

点击右上角下载图标，点击图片下载即可完成图片的下载

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参考文献

Zuguang Gu, Lei Gu, Roland Eils, Matthias Schlesner, Benedikt Brors, circlize Implements and enhances circular visualization in R. Bioinformatics (Oxford, England) 2014. 

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示例数据下载地址

链接：https://pan.baidu.com/s/1ipxSX1macChJ9JKL4EYtqw

提取码：q12x