2021-11-26 如何下载一个基因的外显子序列

作者: __一蓑烟雨__ | 来源:发表于2021-11-26 22:23 被阅读0次

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1 打开NCBI主页，下拉菜单，选择gene选项

image.png

2 输入基因名称，以SDC2为例，点击搜索

image.png
3 选择所要下载的物种及基因，点击基因名称；将鼠标停留在所要寻找的mRNA上（NM开头的序列代表不同的mRNA)，出现如下界面，在Download FASTA选项中点击NM_002998.4 exons

image.png

4 下载fasta格式文件

image.png

5 文件内容如下

image.png

同时也可以将剪切体名称NM_002998.4 输入到
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/splign/splign.cgi?textpage=online&level=form

image.png
比对结果如下：

image.png

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