RT-qPCR:以cDNA为模板进行PCR,在PCR扩增过程中,通过收集荧光信号,对PCR进程进行实时检 测。由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct 值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以可以定量
- 探针类:包括TaqMan探针和分子信标,利用与靶序列特异杂交的探针来指示扩增产物的增加;
- 非探针类:其中包括如SYBR Green I或者特殊设计的引物(如LUX Primers) 通过荧光染料来指示产物的 增加
- 在实时PCR扩增过程中,荧光信号被收集,转化为成为扩增和熔解曲线。具体数据就是基线,荧光阈值和 Ct值。
基线(baseline):一般来讲,第3-15个循环的荧光值就是基线,是由于测量的偶然误差引起的。
阈值(threshold):阈值一般是基线的标准偏差的10倍。在实际操作中也可以手动调节,位于指数期 就可以。
Ct值(Ct value):Ct值就是荧光值达到阈值时候的PCR循环次数。所以是一个没有单位的参数。跟初 始模板的量呈反比。
步骤:
- 配置PCR反应液: Takara RR820A试剂盒
于冰上配制如下反应体系。
试剂 使用量
SYBR Premix Ex Taq II (2) 10.0μL
PCR Forward Primer (10uM) 0.8μL
PCR Reverse Primer (10uM) 0.8μL
ROX Reference Dye II (50) 0.4μL
cDNA 溶液 2.0μL
DEPC 水 6.0μL
Total 20.0μL - 两步法扩增:Stage 1: 预变性 95℃ 30s
Stage 2: PCR 反应 95℃ 5s 60℃ 30s,40cycles
错误分析
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