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单基因生信又发准7分SCI,放到以前不敢想,现在一切皆有可能。

单基因生信又发准7分SCI,放到以前不敢想,现在一切皆有可能。

作者: 生信小课堂 | 来源:发表于2023-05-06 10:31 被阅读0次

    大家好,今天要和大家分享的是2021年4月刚发表的一篇文章:“EVA1B to Evaluate the Tumor Immune Microenvironment and Clinical Prognosis in Glioma”。

    发表杂志:frontiers in Immunology

    影响因子:5.085,即时影响因子:7.29

    对于单基因的分析,挑选基因最为关键。小编认为容易发表的基因要符合以下几点(符合条件越多越好):

    1 在多种肿瘤中该基因高表达

    2 在多种肿瘤中该基因高表达的患者预后差

    3 在多种肿瘤中该基因在高分期表达较高

    4 不同肿瘤中的富集分析有比较集中的几种结果

    5 在一种或者多种肿瘤中与特定免疫细胞浸润相关,如巨噬细胞,CD8T细胞等

    6 最好用不同的方法证明5中的结论

    7 在某一种或者几种肿瘤中集中于一些免疫相关基因相关性高

    8 该基因最好报道过,但是又研究较少,有一定新颖性

    如果能筛选到这样的基因,再添加单基因的各种层面分析,肯定是比较容易接收的。能再加一些实验验证就更好不过了。另外,我们也推出了单基因泛癌高阶套路。详见往期发文!
    需要了解的话欢迎交流。
    另外还有生信福利送给大家

    结果部分

    Figure 1:该基因在胶质瘤中的表达,以及在细胞的定位

    Figure 2:该基因在胶质瘤中不同临床特征中的表达

    Figure 3 该基因在不同临床特征分类中的生存分析

    Figure 4 该基因的1年3年5年的ROC曲线,并且与临床特征作比较,要优于临床特征。

    Figure 5 该基因的富集分析以及蛋白互作网络

    Figure 6 该基因与免疫细胞以及免疫分数的相关性分析

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