awk '2<42767716 {print 4"\t"$5}' >R04_R4_1.vcf
tabix index 提取指定染色体 BCFTOOLS 设置 统计有多少个SNP: 过滤 F_MISSING M...
提取指定区域基因组序列 单个序列,samtools faidx 提取:samtools faidx referen...
问题背景: 做GWAS分析,对方只提供了具有SNP和indel的vcf文件,需要提取SNP时,提取时去发现,需要对...
有snp的坐标,提取snp位点前后100bp的参考基因组 对snp位点bed文件 start 减10 ,end 加...
使用INDEX获取指定位置的数据 格式:INDEX(保存数据的区域,提取第几行,提取第几列) 注意:当第一个参数的...
若想要从sam或bam文件中提取指定区域内的reads,可以使用samtools和bedtools来实现。 首先...
cut cut以行为处理单位,提取指定区域数据。 cut -bn ,以字节(byte)为分割单位-b ...
利用bedtools能够快速批量的提取基因组上指定区域的序列。 1. Example: 文件说明example_g...
今日分析遇到的问题GWAS结果合并很多SNP,想在注释文件中提取某些SNP的注释信息,本来想用R分析,奈何小麦的注...
本文标题:2022-06-22VCF中提取指定区域的SNP
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/njnyvrtx.html
网友评论