https://kns.cnki.net/kcms/detail/11.5840.Q.20190415.1851.010.html
导入矩阵数据和引导树
![](https://img.haomeiwen.com/i19935567/01c942626065cb09.png)
设置节点,为后续约束树形和添加化石分歧时间做准备。
![](https://img.haomeiwen.com/i19935567/7b3f72143c193105.png)
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Tips
Traits
因为没有使用端点和特征,位点设置中选择模型![](https://img.haomeiwen.com/i19935567/36fa25920b69b17a.png)
选择分子钟
![](https://img.haomeiwen.com/i19935567/2950a51dbb65c5d4.png)
选择树以及树形先验概率
Tree Prior一般使用
Speciation: Yule Process
或者Speciation: irth-Death Process
![](https://img.haomeiwen.com/i19935567/1c05628778c29050.png)
Priors设置
这一步添加设置节点的分歧时间
![](https://img.haomeiwen.com/i19935567/0122af65ec6107fb.png)
选择正态分布更没有严格边界
![](https://img.haomeiwen.com/i19935567/f358e8bf0dcde30f.png)
Operators设置
这里我一般用默认设置
![](https://img.haomeiwen.com/i19935567/71be2c42e5aa7384.png)
最后mcmc设置运行代数、抽样频率
![](https://img.haomeiwen.com/i19935567/d86dafdf3162c9ff.png)
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