生信常用linux基础语法

作者: 落寞的橙子 | 来源:发表于2019-05-24 22:43 被阅读2次

移动目录下所有文件

find . -name "*.bam" -type f -exec mv {} ~/ChIP_seq/bam \; 
find . -name "*.bai" -type f -exec mv {} ~/ChIP_seq/bam \; 
find . -name "*.fastq.gz" -type f -exec mv {} ~/ChIP_seq/fastq \; 

批量重命名

ls *_all_indel.bed | while read id ;
do
mv $id `echo ${id%_all_indel.bed*}_all_indel.vcf`
done

awk筛选提取大文件

相关文章

网友评论

    本文标题:生信常用linux基础语法

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/btlozqtx.html