自然医学是发挥自我的主观能动性，不打针，不吃药，不求医生，不住医院，依靠一个有效的工具或方法，以自我诊断，自我治疗，自我康复，达到延年益寿、祛病健体为目的的一套理论。
自然医学虽然在人类防御疾病的历史上起着积极作用，但作为理论来应用，还是得益于西方医学工作人员的不懈努力，自然医学的本源是利用自然界存在的物质和人的主观能动性来预防和治疗疾病，在这一过程中，不可能单独依靠个人的能力来进行，这需要借助于专业的知识才能完成，西方国家对这类专业人员要求比较严格，需要通过专业的国家考试才能执业。我们国家的中医大夫更测重于自然疗法对人体进行调理。应用于自然疗法的方法很多，最基础的是饮食和有规律的锻炼。中医草药，针炙，刮痧，火罐，水疗,火疗等皆可称为自然疗法。
不论是西医还是中西，也不论是少数民族医学还是地域性医学，包括巫术、气动、针灸等，上溯其源头，皆来自于自然医学。自然医学是各种医学的起源，是各种医学的萌芽状态。各种医学是自然医学在后来的发展过程中的不同表现形式。
自然医学虽然起源于蒙昧，但随着科技的发展，自然医学已成为未来医学的发展方向，具有无可比拟的优势，然而，现在的真实情况是，大多数情况下，自然医学依然用来辅助治疗疾病，这与自然医学发展的相对不完美有关。
自然医学是利用自然环境、自然界本身存在的物质医治疾病，或动员人本身的能力使身体恢复健康的医学。由此，使用自然生长的生物和矿物作药物治病的中医（蒙医、藏医），以及世界各国、各民族使用的各种非化学合成药物、非手术医疗方法，均为自然医学。虽然自然医学医疗方法的产生源远流长，但这一术语的使用和流行是近二三十年之事。因针对化学药物充斥、药物的副作用大量出现、食物大量加入化学添加剂，饮食结构改变造成食原病增多的医学现象和社会现实，故而出现次术语。这是人们对化学合成药物的一种反抗，也是人们对自然的回归，故自然医学主张归真返朴，顺乎自然。
自然疗法在理论层次上从属于自然医学，但在实际中两者几乎是同义语。用自然医学理论指导日常生活以保持健康，又称自然保健法。现代自然医学理论、方法流派纷繁，较盛行的有温泉、森林、饮食、睡眠、睡姿矫正、音乐、生物反馈、气功、指压、按摩、导引、运动、针灸、中医等多种疗法，且每种均有理论体系和不同派别。在全球环境日趋恶化，化学药品致畸、致癌、致突变日益明显的情况下，提倡自然医学对保护自然环境、维护生态平衡、节能、维护人类健康等许多方面，均有重要的积极意义。
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