美文网首页生信星球培训第二十六期
学习小组Day3笔记--李斯亭

学习小组Day3笔记--李斯亭

作者: 李斯亭 | 来源:发表于2019-10-16 20:26 被阅读0次
今天主要linux学习安装软件: Day3思维导图

准备工作

  • 安装bzip
  • conda是linux系统的app store

安装miniconda

mkdir biosoft
cd biosoft
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

  • 添加镜像

使用miniconda

  • 查看、搜索

conda list
conda search NAME

  • 安装、卸载

conda install NAME -y
conda remove NAME -y

conda环境

  • 查看环境

conda info --envs

  • 新建环境
    建立一个名叫rnaseq的conda环境,然后指定python版本是3,安装软件fastqc、trimmomatic:

conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y

  • 激活与退出

conda activate rna-seq
conda deactivate

回到base环境

相关文章

网友评论

    本文标题:学习小组Day3笔记--李斯亭

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/nqzumctx.html