如何在R里面将Ensembl ID转换为Gene Symbol

作者: 台式计算机 | 来源:发表于2020-03-17 20:18 被阅读0次

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下面以人类基因为例：

library('biomaRt')

mart <- useDataset("hsapiens_gene_ensembl", useMart("ensembl"))

genes <- rownames(pbmc.markers)

G_list <- getBM(filters= "ensembl_gene_id", attributes= c("ensembl_gene_id","hgnc_symbol"),values=genes,mart= mart)

其中genes为一个向量，打印出来，如：

[1] "ENSG00000197579" "ENSG00000123096" "ENSG00000143815" "ENSG00000118257"

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