🌼琉璃苣的花语是机智和勇气,象征着美好的祝福
紫草素及其衍生物是中药紫草的主要成分,虽然其药理潜力已被广泛研究,但关于紫草科琉璃苣属植物的根际微生物组合却知之甚少。研究者通过PacBio 16S rRNA 测序技术研究了两种琉璃苣属植物:Echium plantagineum (EP) 和Lithospermum erythrorhizon(LE)的三种根室和两种不同土壤类型的微生物组成模式。
文章题目:两种不同土壤类型中产生紫草素的琉璃苣属植物的微生物组合差异
发表期刊:Scientific Reports(IF=3.998)
发表时间:2021年5月
实验设计:采集两种植物;两种土壤:泥炭盆栽人工土壤(PP)、自然校园土壤(NC); 三个根室:根际(RS)、根表面(RP)和内圈(EC)的土壤样本三代多样性测序,探究寄主、土壤理化性质及生态位对微生物群落组成的不同选择压力。
分组间微生物群落差异比较
α和β多样性分析显示,NC土壤微生物丰富度和多样性显著高于PP土壤,三个根室(根际、根表面、内圈)均含有不同的微生物,其中根际物种多样性的程度最高。研究发现,每个土壤都有其微生物池,植物从那里招募出最有利的微生物成员,导致不同的微生物群结构。
图1 堆叠柱状图显示两种寄主根部(RS、RP和EC)相对于大块土壤的门水平物种相对丰度;Venn图显示特殊和普遍OTUs的数量 图2 NC和PP土壤微生物的比较分析微生物OTUs分析
对不同微生物OTUs的分析显示,Planctomycetes和Bacteroidetes在EP和LE根际特异性富集,而内圈以Cyanobacteria为主。网络分析显示:共存的微生物物种在不同的群落中显示不同类型的正和负相互作用。这里提供的数据将有助于提高对植物-微生物群相互作用的理解。在未来,这些信息将有助于通过微生物工程来提高潜在寄主植物的生产力。
图3 直方图代表在EP和LE根室均存在的10种微生物物种的正、负共发生分析参考文献:
Differential microbial assemblages associated with shikonin-producing Borage species in two distinct soil types.
DOI:10.1038/s41598-021-90251-1
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