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TCGA官网数据下载整理分析方法

TCGA官网数据下载整理分析方法

作者: 小白兔和小毛驴 | 来源:发表于2021-12-06 19:26 被阅读0次

自己没有整理过（目前都是用的现成的），所以没有整理好的代码，如果遇到需要自己整理参考以下网址（TCGAbiolinks）：此方法可以整理出FPKM格式的数据

https://www.jianshu.com/p/3b4c07f7e5f3

或者另一个包，官方网址如下，但是缺点是这种方法只能整理出Count格式的数据

https://bioconductor.org/packages/devel/bioc/vignettes/GDCRNATools/inst/doc/GDCRNATools.html

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