家族成员的确定
找到 ”Batch-CDD"工具，输入上一步获得的
hitdata.txt文件，以及蛋白序列文件，点击"start“，对其结构进行可视化.
基因家族的特征测定
- 计算等电点、分子量等需要tab格式，这里我们用到tbtools的”Fasta to Table Convert"工具来进行格式的转化，如下图。
- 用excel打开刚刚的tab文件，将蛋白序列单独复制到新的文件
rice.pep.txt。
- 利用Expasy来预测蛋白的分子量和等电点。
- 结果如下图所示，各个结果为单个蛋白的结果。
5.点击下方链接，复制到excel，然后对数据进行分列就可以。
基因家族motif分析
- 打开meme网页，按下图填写参数即可；
[可选] 如果你想使用linux版本的meme，参数设置如下即可。
- 等待结果，选择
MEME XML output，右键链接另存为保存即可；
3.meme结果可视化：利用tbtools工具的MEME工具，选择刚刚的
meme.xml来展示meme结果。
基因家族的基因结构分析
- 下载水稻基因组gff文件。
- 选择tbtools的
Visuailize Gene Structure (from GTF/GFF3 File)工具。
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