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2018-08-15从华大数据交付中心获取测序数据到本地Linu

2018-08-15从华大数据交付中心获取测序数据到本地Linu

作者: YPCHEN1992 | 来源:发表于2018-08-16 09:33 被阅读0次

    通常我们在华大完成测序后,数据会上传到下面这个位置

    华大基因数据交付系统.png

    然后呢,我们会得到一个邮件:

    您的数据已上传至FTP,还请您及时下载。
    网址:http://cdts-wh.genomics.cn
    账号:xxxxxxxxxxxx
    密码:xxxxxxxxxxxx
    老师您可以用filezilla这个软件下载.
    主机:cdts-wh.genomics.cn
    账号:xxxxxxxxx
    密码:xxxxxxxxxx
    端口不用写。
    附件2为软件说明,附件3为软件压缩包,支持Windows64位使用。
    温馨提示:在完成版数据上传至FTP服务器后,所有序列文件和相关分析结果文件将在1个月后删除。
    请您收到邮件后尽快完成下载,并对文件是否可以打开等进行核实,如因网络等原因无法顺利下载请及时与我们联系。

    一般情况下
    数据量小,10G以内或没有服务器的直接使用华大推荐的filezilla软件下载,数据交付的邮件里有使用说明,数据量大的话可以在服务器上,让自己的服务器在后台帮忙下载,不影响自己使用电脑.

    服务器下载FTP数据方法

    wget [option] ftp://username:password@ip:port/file
    或
    wget ftp://ip:port/file --ftp-user=username --ftp-password=password
    或
    wget ftp://username@ip:port/file --ftp-password=password
    或
    wget -m --ftp-user=tom --ftp-password=123456 ftp://192.168.19.1/tom/  
    # -m表示下载目录及子目录;
    #[option] 是wget的命令参数,这个有需要的自己百度哈,毕竟百度是最好的导师,哈哈哈
    #username-上面给的账号
    #password-上面给的密码
    #ps:“:”不能丢
    #@后面是地址,再后面就是目录了。
    #想要后台运行的话这样在命令前加nohup,命令后加 &
    nohup wget [option] ftp://username:password@ip:port/path/to/folder &
    

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