【目标区域捕获-2】目标区域捕获简介

1.背景

目标区域测序（Target region sequencing）是通过定制感兴趣的基因组区域的探针，与基因组DNA进行杂交，将目标区域DNA富集后进行高通量测序的研究策略。通过对大量样本的目标区域研究，有助于发现和验证疾病相关候选基因或相关位点，在临床诊断和药物开发方面有着巨大的应用潜力。

2.技术优势

• 高密度信息
  针对目的基因组区域进行遗传变异位点检测
• 高准确性
  对特定区域深入研究，得到更深的覆盖度和更高的数据准确性，提高了对稀有变异的检测能力
• 高性价比
  更经济有效，更高通量，适合大样本量研究
• 更快捷
  缩短研究周期，加快文章发表与加速临床应用

3.取样方式

通过某种方法有选择性的分离或者富集基因组的特定片段。
PCR：通量小，成本高昂，稳定性差
杂交法：依据核酸分子碱基互补杂交原理发展的，根据杂交时状态的不同分为固相杂交法和液相杂交法。

3.1固相捕获

（1）选定目标DNA区域，在修饰了的玻璃片基上原位合成一系列与目标区域互补的探针。
（2）在芯片上进行DNA与探针的杂交反应。
（3）将与探针杂交的DNA洗脱下来，用于后序的测序工作。

3.2液相捕获

（1）在溶液中，目标DNA片段和已带有生物素标记探针直接杂交，然后通过生物素亲和素的反应使目标DNA片段锚定在带有亲和素的微珠上。洗去非目标DNA，洗脱后，富集的DNA用于测序。
（2）杂交效率更高
（3）易于操作，时间短，便于自动化操作

4.实验流程

5.应用领域

目标区域捕获适用于疾病的大样本量分析包括帕金森、智力障碍、扩张型心肌病、乳腺癌等多种疾病的研究。
针对临床应用，适用于单基因遗传病检测、癌症易感基因检测、心脑血管疾病基因检测、用药指导基因检测等。

6.常见问题

更多问题可以查看：
公众号oddxix文章：【目标区域捕获-1】目标区域捕获常见问题集锦

数据分析思路和外显子测序类似。可参考：
公众号oddxix文章：【外显子测序-2】全外显子组测序

关于重测序、外显子测序与目标区域捕获差别，只是测序对象大小不同，重测序是针对整个基因组，外显子是针对外显子区域，而目标区域捕获是针对我想要研究的那一段序列。分析流程差不多。