今天和老师汇报了一下近期的工作。
接下来要做的主要是对甲基化的调用文件进行进一步的证实。最好还是用raw data做分析。
将不同组织的数据做成一个数据集,用SPM的算法进行分析,分析其特异的甲基化位点。
平行的基因数据集也需要留意。
某个位点的甲基化程度如何理解?
可以理解为一个概率,而不是0或者1事件。
因此找到的低甲基化或者高甲基化其实是低概率或者高概率。
行:不同的CpG位点
列:不同的组织
值:甲基化位点
CpG位点可以对应到基因(外显子 内含子 启动子)
今天和老师汇报了一下近期的工作。
接下来要做的主要是对甲基化的调用文件进行进一步的证实。最好还是用raw data做分析。
将不同组织的数据做成一个数据集,用SPM的算法进行分析,分析其特异的甲基化位点。
平行的基因数据集也需要留意。
某个位点的甲基化程度如何理解?
可以理解为一个概率,而不是0或者1事件。
因此找到的低甲基化或者高甲基化其实是低概率或者高概率。
行:不同的CpG位点
列:不同的组织
值:甲基化位点
CpG位点可以对应到基因(外显子 内含子 启动子)
本文标题:短期小结
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