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sequins--人工合成DNA测序内参控制方法

sequins--人工合成DNA测序内参控制方法

作者: 生信小书童 | 来源:发表于2021-05-07 18:10 被阅读0次

1 用处

Sequins(sequencing spike-ins)是一种人工合成DNA标准品,它可以混入到目标DNA样品中,在基因组测序和分析过程中充当内参。用检验NGS文库构建效果、检测测序错误,测试分子诊断能力。


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2 使用

Sequins通常以1%的比例加入到人DNA样品中。Sequins和目标样品经历相同的NGS流程,积累同样的测序错误和偏倚。在测序之后,Sequins的reads可以通过特定的标记进行分离出文库。因此,它可以当做内参进行分析并进行质量控制。


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3 分析

Sequins搭配anaquin软件可以用于流程性能评估和实验室测序、生信流程评价。


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参考文献:

[1] Blackburn J , Wong T , Madala B S , et al. Use of synthetic DNA spike-in controls (sequins) for human genome sequencing[J]. Nature Protocol, 2019, 14(7):1.
[2] https://www.sequinstandards.com/genome/

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