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P值转化为Padj

P值转化为Padj

作者: 余绕 | 来源:发表于2020-06-18 15:21 被阅读0次

    把计算出来的\color{#ea4335}{所有p值}储存成一个数组,然后调用函数\color{#4285f4}{p.adj()}计算,\color{#fbbc05}{具体代码如下:}
    \color{#34a853}{注意:} 一定是所有p值(要计算的p值集合,不能单独只计算一个p值),因为p.adj简单来说就是再p基础上再筛选出新的p值。

     p=c(0.01,0.005,0.003,0.010,0.1,0.03,0.0010,0.003,0.05,0.09)
    > p
     [1] 0.010 0.005 0.003 0.010 0.100 0.030 0.001 0.003 0.050 0.090
    > P.adj=p.adjust(p,method = "fdr") #这里method可以选择:"holm", "hochberg", "hommel", "bonferroni", "BH", "BY","fdr", "none" 等
    > round(P.adj,digits =3)
     [1] 0.017 0.012 0.010 0.017 0.100 0.043 0.010 0.010 0.062 0.100
    

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