- 1.Lnc2Cancer
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Lnc2Cancer简介
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Lnc2Cancer是一个人工管理的数据库,它提供了lncRNA和人类癌症之间全面的实验支持的关联。通过对6500多篇已发表论文的分析,当前版本的lnc2cancer记录了1614个人类lncRNas和165个人类癌症亚型之间的4989条关联。尤其是,lnc2cancer还提供了实验支持的循环、抗药性和癌症预后lncRNas。此外,还显示了由microRNA(microRNA)、转录因子(tf)、变异和甲基化调节的lncrnas。
Lnc2Cancer
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相关文献:
- 1.Lnc2Cancer v2.0: updated database of experimentally supported long non-coding RNAs in human cancers, (Nucleic Acids Research, 2018)
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2.Lnc2Cancer: a manually curated database of experimentally supported lncRNAs associated with various human cancers, (Nucleic Acids Research, 2016)
其他资料:
lnc2Cancer:lncRNA相关肿瘤数据库
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- 2.Lnc2Meth
- Lnc2Meth简介
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LncRNAs在调控基因表达或参与一些重要的表观遗传调控过程中发挥重要作用,包括染色质修饰或DNA甲基化。DNA甲基化是表观基因组的一个基本特征,可影响蛋白编码或非编码转录本的表达。在此,作者构建了Lnc2Meth,旨在为阐明人类lncrna与多种疾病相关DNA甲基化之间的调控关系提供一个全面的资源和web工具。
Lnc2Meth
- 相关文献
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其他资料
Lnc2Meth:与疾病相关的lncRNA上的甲基化位点
- 3.LncACTdb
- LncACTdb 简介
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LncACTdb 2.0是一个更新的数据库,aim to integrate manually curated and predicted ceRNA interactions.该数据库的范围扩大到20多种物种和数百种疾病.LncACTdb 2.0试图提供一个全面的资源和web工具来阐明不同疾病中不同类型rna之间的ceRNA关系。
LncACTdb
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相关文献:
- 1. LncACTdb 2.0: an updated database of experimentally supported ceRNA interactions curated from low- and high-throughput experiments, (Nucleic Acids Research, 2018).
- 2. Identification of lncRNA-associated competing triplets reveals global patterns and prognostic markers for cancer, (Nucleic Acids Research, 2015).
- 4.MSDD
- MSDD简介
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msdd(MiRNA SNP Disease Database)是一个人工管理的数据库,它提供了micrornas(mirnas)、single nucleotide polymorphisms(snps)和人类疾病之间全面的实验支持的关联。miRNA相关功能区的单核苷酸多态性,如mature miRNAs, promoter regions, pri-miRNAs, pre-miRNAs and target gene 3'-UTRs,统称为“miRSNPs”(一类新的功能分子)。mirsnps可导致microrna及其靶基因失调,并导致人类疾病的易感性或发病。MSDD致力于收集和存储最新的实验支持的microrna-snp疾病关联。通过对2000多篇已发表论文的回顾,MSDD目前记录了182个人类miRNAs、197个SNPs、153个基因和164种人类疾病之间的525种关联。
MSDD
- 相关文献
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