如何将miniconda下载到服务器上
- 百度搜索“miniconda 清华”,进入网站;
- 进入minconda安装包网址;
- 先查看服务器的位数,输入命令 uname -a,我的linux是x86_64;
- 在网站上选择相应位数的miniconda,如https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh;
- 右键——复制下载链接
- 服务器上进入 biosoft目录;
- 输入wget 刚才复制的下载链接;
怎么安装miniconda
- 输入bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh;
- 中间的过程,有enter按enter,有yes按yes;
- 出现Thank you for installing Miniconda3!,说明安装成功;
- 如果失败,删除miniconda目录,从bash重来;
- 激活,输入source ~/.bashrc,再输入conda。
添加镜像(这步不能省略)
conda在国外,我们在国内下载软件速度会很慢,因此需要配置镜像,输入以下代码。
Snipaste_2022-03-30_20-49-00.png
使用conda
- 查看当前服务器上安装的所有软件列表,conda list;
-
安装软件conda install fastqc -y,如果出现以下情况,说明没有配置镜像;
Snipaste_2022-03-30_20-48-17.png - 确认fastqc软件是否安装成功,输入fastqc --help,如果出现一大片文字,这是软件的帮助文档;
-
卸载软件,conda remove fastqc -y,这边我就卡住不动了,按crtl+C取消就行。
linux环境下的软件安装.png
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