注：仅作个人科研生涯学习思考之用，侵删。
单细胞笔记5-tSNE和UMAP 作者：江湾青年
注：仅作个人科研生涯学习思考之用，侵删。 单细胞笔记5-tSNE和UMAP[https://www.jianshu...
UMAP 将会与tsne一样作为高纬数据可视化的利器，并且优于tsne. UMAP 与 t-SNE 均是非线性降维...
umap发现自己的簇顺序有问题 设置一下因子就好 ggplot绘制umap图 你到底想要什么样的umap/tsne...
这一篇是我的学习笔记，先附上学习链接：https://mp.weixin.qq.com/s/qkbc1vz-ERH...
降维 降维顾名思义就是把数据或特征的维数降低，一般分为线性降维和非线性降维，比较典型的如下： 线性降维：PCA(P...
Seurat包展示出来的umap/tsne图都是带有横纵坐标，基于Seurat包可能比较难调整图片的样式，只能借助...
随着单细胞通量的提高，对我们的计算速度要求也越来越高。我们知道在绘制图谱的时候现在有两个选择:tsne和umap。...
今天的内容讲讲单细胞文章中经常出现的展示细胞marker的图：tsne/umap图、热图、堆叠小提琴图、气泡图，每...
本来呢，单细胞UMAP或者TSNE降维图正常展示就好了，最多修改颜色坐标就可以，但是奈何总是有文章挑战别人的眼睛，...
在上一篇中，我已经讲解了展示marker基因的前两种图形，分别是tsne/umap图、热图，感兴趣的读者可以回顾一...
本文标题：tSNE和UMAP
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