生信学习小组Day5 --ldj

R语言学习2 数据结构

• 数据框的读取与导出

# "\t"制表符分割
a <- read.table(file = "huahua.txt", sep = "\t", header = T)

b <- read.csv("huahua.txt", sep = ",", header = T)
#修改行列名
colnames(a)[1] = "bio"
rownames(a)[1] = "bio"
#数据导出，分隔符可调整
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)

write.csv(X,file = "yu.txt",sep = "\t",quote=F)

• 变量保存与重新加载

  save.image(file="test.RData")
  # 保存当前所有变量
  save(X,file="a.RData") 
  #保存其中的X变量
  load("test.RData")
  # 重新加载
  

• 提取元素

  [1,2] 单元素

  [c(1:3),] 1-3行

  [,c(1:3)] 1-3列

  X$列名 只能提取一列

• 一键清除环境里的变量

  rm(list=ls())

• 直接使用数据框中的变量,而不需要每次用到变量（列名）时都去打一次数据框

  options(stringsAsFactors = T)
  a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
  #传统做法
  plot(a$case,a$values)
  #高效做法1 attach函数，将该数据框添加到目前的搜索环境中
  attach(a)
  plot(case,values)
  detach（a）
  ##高效做法1 with 函数
  with(a,{
   plot(case,values)
  x<<-summary(values)   
  #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，也就是出了大括号仍有效。
  })
  x #运行完后打印x
  
  

• 作业：environment面板里肯定是没X变量所致