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2021-07-07 RBP知多少

2021-07-07 RBP知多少

作者: NAome | 来源:发表于2021-07-07 22:16 被阅读0次

            RNA作为遗传信息传递与调控分子,在各种细胞生命活动中发挥着至关重要的作用。细胞中,RNA合成、加工、转运、翻译、降解以及功能发挥都需要有蛋白质的直接参与,这类与RNA直接结合的蛋白质就称为RNA结合蛋白(RNA binding protein,RBP)[1]。RBP通过其RNA结合域(RNA-binding domain,RBD)直接与RNA结合,以核糖核酸蛋白复合物(Ribonucleoprotein,RNP)的形式,参与细胞生命活动调节。

            截止目前,各种方法鉴定的RBP有3470个,其中有1777个RBP预测具有RBD,而其中859个是被实验验证具有RNA结合能力的RBD[2]。针对RBP的系统分类尚未形成广泛共识。有按照RBP具有的RBD进行分类,例如按照常见RBD,RNA recognitionmotif (RRM),K-homology(KH),DEAD/DEAH helicase和Zinc-finger domain等分成不同RBP家族[3];或者按照RBP结合的RNA类型分成:mRNA结合的RBP,pre-rRNA结合的RBP,tRNA结合RBP,snRNA结合RBP,snoRNA结合RBP和ncRNA结合RBP等[4]。

    Reference

    [1].        Hentze MW, Castello A, Schwarzl T, etal. A brave new world of RNA-binding proteins. Nat Rev Mol Cell Biol, 2018, 19:327-341

    [2].        Gebauer F, SchwarzlT, Valcárcel J, et al. RNA-binding proteins in human genetic disease. Naturereviews Genetics, 2021, 22: 185-198

    [3].        Liao J-Y, Yang B,Zhang Y-C, et al. EuRBPDB: a comprehensive resource for annotation, functionaland oncological investigation of eukaryotic RNA binding proteins (RBPs).Nucleic Acids Res, 2020, 48: D307-D313

    [4].        Gerstberger S,Hafner M, Tuschl T. A census of human RNA-binding proteins. Nat Rev Genet,2014, 10.1038/nrg3813

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