序列比对:将测序reads与已知序列信息的基因或基因组进行比对,比对结果格式比较常见的是sam和bam文件。sam...
一、sam、bam简介 1、sam Sequence Alignment/Map format,直译就是序列比对格...
what is bam bam(或者是sam,cram)文件,是比对后拿到的文件,sam文件是纯文本,非常占用存储...
1. sam 和 bam 背景知识 现在最流行的短序列比对软件就是bwa 和 bowite2,而sam文件就是通过...
常用samtools的命令: samtools view命令:查看sam,bam文件,进行sam及bam文件的转换...
整理高通量测序中使用的软件。 比对软件产生的序列通常是随机的。然而,比对后的分析步骤通常要求sam/bam文件被进...
Samtools 是一组实用程序,用于操作 SAM(序列比对/映射)、BAM 和 CRAM 格式的比对。它在格式之...
参考:碱基矿工生信学苑 通常我们可能会看到.cram,.sam,.bam等多种序列比对的文件,其实他们的本质都源于...
samtools是一个用于操作sam和bam文件(通常是短序列比对工具如bwa,bowtie2,hisat2,to...
使用工具 fastp(质控), hisat2(比对), samtools(sam文件转bam文件), featur...
本文标题:序列比对及BAM、SAM文件
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