本质上是RNA 有参比对,用于基因组已经研究很透彻的比对方法,看看能不能找到新的转录本
RNA-seq比对软件STAR的学习笔记
本质上是RNA 有参比对,用于基因组已经研究很透彻的比对方法,看看能不能找到新的转录本 RNA-seq比对软件ST...
tags: RNA-seq GATK STAR SNP INDEL RNA-seq 序列比对 对 RNA-seq ...
欢迎关注”生信修炼手册”! STAR是目前主流的RNA-seq比对软件之一,而STAR-fusion就是一款基于S...
一般对于DNA数据,比对软件一般使用:bowtie2、bwa 对于RNA数据,比对一般使用:hisat2、star...
conda create -n rna_seq 安装软件 经过质控后,采用STAR进行比对 虽然做的是无参转录组,...
原文献:STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner 一、比对原理 背景 1...
数据下载 sra下载ncbi数据 star 比对 star软件的简单使用star官方文档 gatk流程
索引构建 构建好索引后,第一次比对 未完待续
比对软件STAR使用说明 Spliced Transcripts Alignment to a Reference...
之前一直做的是DNA , 就一直用BWA ,刚接触RNA,查了文献,STAR 比对准确性更好。 先记录STAR 的...
本文标题:star RNA比对软件
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