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学习小组Day3笔记--Ever After

学习小组Day3笔记--Ever After

作者: f90ea41130ae | 来源:发表于2019-01-16 19:52 被阅读15次

    软件安装

    yum install -y 软件名

    下载miniconda

    1. 登陆服务器,进入biosoft目录

    cd biosoft

    1. wget命令

    wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

    安装miniconda

    bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

    激活conda

    source ~/.bashrc

    鼠标左键点一下是复制,右键点一下是粘贴

    添加国内镜像

    conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free
    conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
    conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
    conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
    conda config --set show_channel_urls yes

    使用conda

    1. 查看当前所有软件列表 conda list
    2. 搜索软件 conda search fastqc
    3. 安装软件 conda install fastqc -y
    4. 卸载软件 conda remove fastqc -y

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