2021-03-06生信技能树-生信入门D5

生信技能树2021生信入门线上课笔记，需要结合课程讲解服用

1.表格文件读取到R语言是数据框，对数据框进行修改不会同步到表格中
读取--编辑修改--导出
最好不要覆盖原文件，让代码可重复，数据可重现

#读取
read.csv(‘’)#通常读取csv格式
ex1=read.table('ex1.txt',header = T)#通常读取txt格式

ex2=read.csv('ex2_B cell receptor signaling pathway.csv',
             row.names = 1,
             check.names = F)

gse=read.table('GSE32575_series_matrix.txt',
             comment.char = '!',#关闭！开头的注释
             row.names = 1,#第一列为行名
             header = T#第一行为列名)

#直接读取如果失败，需要指定一些参数

#数据框导出为表格文件
write.csv(test,file = 'example.csv')#csv格式，把变量为test的数据框导出为文件名为example的csv文件

报错的原因
1）文件不在工作目录下
2）文件名输入错误
3）默认参数不适用于当前读取的文件

2. Rdata是R特有的数据存储格式，无法用其他软件打开（.R脚本，.Rdata数据）
   保存的是变量，不是表格文件，不涉及赋值

save(test,file = 'example.Rdata')#保存，file=不能省
load('example.Rdata')#加载

数据读取指南https://www.jianshu.com/p/4ea320c0dcc6