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第0周 我对生信的理解

第0周 我对生信的理解

作者: chaimol | 来源:发表于2017-10-16 09:29 被阅读50次

本科是植物保护专业,现在在读农学类研究生。本科时接触到前端开发,学习了四个月。

生物信息学我是从陈琳琳老师那里听到的名词。似乎是编程和生物学结合的学科。主要工作是编程做软件。    --本科阶段认知

研究生入学后,遇到实验组郭老师(美国俄克拉荷马大学计算生物学博士毕业),决定学习生物信息学。

先后查询许多资料,关注几个活跃的生物信息学公众号(生信媛,生信技能树等)。开始准备Linux系统,下载打印《R in action》,《鸟哥私房菜》。

目前认知的生物信息学。接触的基因定位相关知识,熟悉了玉米基因定位的整个流程。通过测序拿到样本序列数据,然后就是生物信息学的数据处理分析。给出匹配结果,功能预测,结构预测,调控机制等。

入门基础:

熟悉Linux系统常用命令结构

学会R语言,掌握常用包的使用。

学会Python。

短期目标:先入门生信(半年),掌握生信常用工具,能满足实验组目前的要工作要求。

至于自己造轮子,开发软件或者分析工具,或许还需要多年吧!先学会别人的工具,然后学习算法。接着优化方案,最后如果自己有能力,可能会造轮子吧!

因专业所限,目前两手抓局面,实属无奈,尽力两端都顾吧。

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