fastp数据过滤

作者: 胡童远 | 来源:发表于2021-08-16 11:10 被阅读0次

fastp一些功能：

下载，安装：

# note: the fastp version in bioconda may be not the latest
conda install -c bioconda fastp

使用：

# single end
fastp -i in.fq -o out.fq
# paired end
fastp -i in.R1.fq.gz -I in.R2.fq.gz -o out.R1.fq.gz -O out.R2.fq.gz

结果报告：

http://opengene.org/fastp/fastp.html

2019-02-19
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fastp数据过滤
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