cutadapt -j 4 -a GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC --quality-base 33 -m 10 -O 4 --discard-untrimmed wy-KO-18d-3.R1.clean.fastq.gz> wy-KO-18d-3.R1.clean.trim.fastq
-m 10 意思是舍弃掉低于10个碱基的reads
--discard-untrimmed 意思是舍弃掉没有adapter的reads
cutadapt -j 4 -a GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC --quality-base 33 -m 10 -O 4 --discard-untrimmed wy-KO-18d-3.R1.clean.fastq.gz> wy-KO-18d-3.R1.clean.trim.fastq
-m 10 意思是舍弃掉低于10个碱基的reads
--discard-untrimmed 意思是舍弃掉没有adapter的reads
cutadapt -j 4 -a GATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCC --quality-ba...
【生信】cutadapt①基本使用方法 cutadapt能够查找并去除接头（adapter），测序引物（prime...
cutadapt是一款去接头并且也能去低质量碱基的软件。至于接头的产生，一般来说是由于在随机打断时，有些片段的长度...
一般来讲，我们对测序数据进行QC，就三个大的方向： Quality trimming Adapter remova...
官方下载和说明 http://www.usadellab.org/cms/index.php?page=trimm...
NGSQC Toolkit用于进行高通量测序数据的质量检查和数据过滤，具有去接头，去除非ATGC碱基，去除低质量碱...
首先查到了一个软件是 Cutadapt https://cutadapt.readthedocs.io/en/st...
For paired-end reads: cutadapt -a ADAPT1 -A ADAPT2 [optio...
1.genome survey 数据过滤去除测序原始数据中可能包含低质量、接头污染以及含 N 过高的 reads ...
利用正则表达式来去除字符串中重复的字符 利用HashMap来去除数组中重复的字符
本文标题：利用cutadapt去除miRNA-seq接头
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/qwmhlqtx.html
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