IMGT/HighV-QUEST是由国际免疫学数据库（IMGT）维护的一款在线的免疫受体序列分析工具。这个工具基于IMGT/V-QUEST，是专门为处理高通量测序（HTS）数据设计的。少于20万的序列可以一次性上传。多的就要拆开了。
IMGT/HighV-QUEST用于分析VDJ重排以及其他的免疫受体序列相关的信息。它可以识别和比对免疫受体基因，提供核苷酸和氨基酸序列，提供序列的功能注释，识别突变热点，等等。这个工具使用IMGT的唯一编号系统，这使得结果可以与其他IMGT工具和数据库进行交互。
IMGT/HighV-QUEST提供了一种方便的方式来处理和分析大量的免疫受体序列数据，使得研究人员可以更容易地理解免疫系统的复杂性和多样性。这个工具已经在许多免疫学研究中被广泛应用，包括疾病相关的抗体响应、疫苗设计、免疫细胞受体工程等领域。
要想使用IMGT/HighV-QUEST，需要在IMGT的网站上注册一个账户（最好是edu邮箱申请，其他邮箱不知道可不可以），然后上传他们的序列数据。然后，可以选择他们想要进行的分析和输出的结果格式。分析完成后可以下载结果文件进行进一步的分析。
输入也很简单，fasta文件就行。跑完时间取决于排队情况，执行时间好像不超过半个小时就完成了。
image.png
会有11或者12个文件生成，然后按照自己的需要查看文件就是了
- Summary (always provided in a spreadsheet and in a TXZ archive)
- IMGT-gapped-nt-sequences
- nt-sequences
- IMGT-gapped-AA-sequences
- AA-sequences
- Junction
- V-REGION-mutation-and-AA-change-table
- V-REGION-nt-mutation-statistics
- V-REGION-AA-change-statistics
- V-REGION-mutation-hotspots
- Parameters (always provided in a spreadsheet and in a txz archive)
- scFv (only present if 'Analysis of single chain Fragment variable (scFv)' was selected in Advanced functionalities)
scFv
单链可变片段（Single-chain Variable Fragment，缩写为scFv）是一种工程化的抗体，由抗体的重链可变区（VH）和轻链可变区（VL）通过一个短的多肽链连接而成。
在自然状态下，抗体是由两个重链和两个轻链组成的，其中重链和轻链的可变区构成了抗体的抗原结合部位。然而，在许多生物技术应用中，使用整个抗体分子可能过于复杂或者不必要。因此，科学家开发了scFv这种只包含抗体的可变区的小分子。
scFv分子保留了原来抗体抗原结合部位的特异性，但是由于它的大小比整个抗体小很多，因此在许多情况下可以具有更好的渗透性和组织分布。此外，scFv的生产成本也通常比整个抗体低。
scFv被广泛应用于许多生物技术领域，包括免疫疗法、诊断测试、以及研究中的抗原识别等。例如，CAR-T细胞疗法中，T细胞表面的人工受体就是由scFv构成的，这使得T细胞能够识别并攻击特定的肿瘤细胞。
在IMGT/HighV-QUEST这个工具中，可以选择进行scFv的分析。这种分析可能包括识别scFv的序列，预测其结构和功能，等等。如果选择了这个选项，结果中就会生成一个scFv.txt的文件，包含了scFv的分析结果。
https://mp.weixin.qq.com/s/d5-dUCKdwyFwIY5Mqhjv6Q
IMGT/HighV-QUEST --- IMGT/HighV-QUEST文档
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