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单细胞转录组绘图视频教程

单细胞转录组绘图视频教程

作者: TOP生物信息 | 来源:发表于2021-11-15 14:12 被阅读0次

    我在B站发布了“单细胞转录组绘图”系列视频教程,一共分了9集,共计57分钟,适合入门single cell和想进阶的小伙伴。

    1. 数据预处理and肿瘤样本去不去批次

    (这个图是没有去批次的)

    2. tsne或者umap降维图的一般画法
    3. 左下角的坐标轴怎么画

    其实是用线段代替了坐标轴

    4. 散点图加等高线加二维密度图

    nature那篇的绘图还有个大圆圈,最后把它俩组合起来就可以了,后期全靠AI

    5. 计算基因集分数_投影图
    6. 热图展示marker基因
    7. 气泡图展示marker基因
    8. 堆叠小提琴图展示marker基因
    9. 条形图展示细胞亚群占比and质控图

    共重号回复20211114有代码和示例数据的获取方式
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