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MySQL:Update语句高并发下变慢的案例及其涉及的知识

MySQL:Update语句高并发下变慢的案例及其涉及的知识

作者: 重庆八怪 | 来源:发表于2022-08-03 09:49 被阅读0次

    本文主要讨论的是RC隔离级别,代码主要集中在5.7.22,为了描述方便本文中涉及的semi update就是官方说的semi-consistent read特性。水平有限,仅供参考。


    一、问题说明

    最近遇到一个问题,以下是模拟出来的现象(RC隔离级别,5.7.31版本),正常情况下,这个update语句的执行时间很快,但是到了高并发情况下就很慢了。


    image.png

    当然这个问题解决很简单,但是其背后还是有很多值得挖掘的地方,这里就从问题分析触发,顺带挖一下其涉及的部分。

    二、分析方式

    既然是update语句并发处理的情况变慢,我们先从常规触发看看是不是被堵塞了。首先我们能看到state为updating状态,那么就说明如下:

    • MDL LOCK堵塞不可能,因为state状态不对MDL LOCK堵塞的现象
    • 可能是row lock堵塞,因为在update语句的情况下row lock堵塞也是updating状态

    进一步通过show engine 和 确认没有出现row lock堵塞,show engine截图如下:


    image.png

    我们可以看到这里事务都处于活跃状态,大部分是unlock_row阶段,也有fetching rows阶段的事务,那么说明事务是在运行的,那么接下来通过CPU耗用确认是否会话出现了内部堵塞,如果长时间的堵塞CPU肯定会下降,如果是在耗用CPU干活就可能CPU就比较高,如下:


    image.png

    我们看到CPU还是比较高的,那么CPU高也有两种可能就是遇到spin 和 正常的代码逻辑,对于spin来讲一般是内部mutex在正式放弃CPU前做的多次尝试,这个和我们的参数spin设置有关,并且show engine 可能会有输出,通过show engine进行确认如下:


    image.png

    这里我们确实可以看到一个mutex叫做LOCK_SYS,接着看看perf信息如下:


    image.png

    确实有大量的ut_delay耗用CPU,且函数指向了加行锁等待上,同时LOCK_SYS也正是row_lock的全局hash结构所在位置的mutex,这就说明了这个语句出现了大量的row_lock需要加锁和解锁,导致LOCK_SYS mutex出现了热点锁。

    接着查看表结构,建表语句如下:

    create table testsemi(a int auto_increment primary key,b int,c int,d int,key(b,c));
    修改语句大概如下:
    update testsemi set d=20 where c=20;
    数据量大约百万左右。
    

    当然这样由于c=20不是索引的前缀,在RR模式下会出现全纪录加锁,而在RC模式下会触发2个优化:

    • Innodb层 semi update
    • MySQL层unlock row

    解决当然也很简单,起码c列上要有个索引能够用到。接下来我们就讨论这两个优化大概实现方式和一个存在的问题。

    三、RC隔离级别下的semi update和unlock row优化

    3.1 相关列子

    为了更好的解释这两种特性我们先来看两个例子,建表语句和数据如下:

    mysql> show variables like '%transaction_isolation%';
    +-----------------------+----------------+
    | Variable_name         | Value          |
    +-----------------------+----------------+
    | transaction_isolation | READ-COMMITTED |
    +-----------------------+----------------+
    mysql> show create table testsemi30 \G;
    *************************** 1. row ***************************
           Table: testsemi30
    Create Table: CREATE TABLE `testsemi30` (
      `a` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
      `b` int(11) DEFAULT NULL,
      `c` int(11) DEFAULT NULL,
      `d` int(11) NOT NULL,
      PRIMARY KEY (`a`),
      KEY `b` (`b`,`c`)
    ) ENGINE=InnoDB AUTO_INCREMENT=29 DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COLLATE=utf8mb4_unicode_ci
    1 row in set (0.00 sec)
    
    ERROR: 
    No query specified
    
    mysql> select * from testsemi30;
    +----+------+------+---+
    | a  | b    | c    | d |
    +----+------+------+---+
    |  2 |    2 |    2 | 0 |
    |  4 |    4 |    4 | 0 |
    |  6 |    6 |    6 | 0 |
    |  8 |    8 |    8 | 0 |
    | 12 |   12 |   12 | 0 |
    +----+------+------+---+
    5 rows in set (0.00 sec)
    
    3.1.2 例子1:
    session1:
    mysql> begin;
    Query OK, 0 rows affected (0.01 sec)
    mysql> update testsemi30 set d=6 where c=6;
    Query OK, 1 row affected (0.00 sec)
    Rows matched: 1  Changed: 1  Warnings: 0
    mysql> desc update testsemi30 set d=6 where c=6;
    +----+-------------+------------+------------+-------+---------------+---------+---------+------+------+----------+-------------+
    | id | select_type | table      | partitions | type  | possible_keys | key     | key_len | ref  | rows | filtered | Extra       |
    +----+-------------+------------+------------+-------+---------------+---------+---------+------+------+----------+-------------+
    |  1 | UPDATE      | testsemi30 | NULL       | index | NULL          | PRIMARY | 4       | NULL |    5 |   100.00 | Using where |
    +----+-------------+------------+------------+-------+---------------+---------+---------+------+------+----------+-------------+
    1 row in set (0.01 sec)
    

    显然这个语句是全表扫描的update,但是最终看到的加锁row lock只有一条如下:

    ---TRANSACTION 808623, ACTIVE 19 sec
    2 lock struct(s), heap size 1160, 1 row lock(s), undo log entries 1
    MySQL thread id 16, OS thread handle 140735862056704, query id 349 localhost root
    TABLE LOCK table `test`.`testsemi30` trx id 808623 lock mode IX
    RECORD LOCKS space id 9694 page no 3 n bits 72 index PRIMARY of table `test`.`testsemi30` trx id 808623 lock_mode X(LOCK_X) locks rec but not gap(LOCK_REC_NOT_GAP)
    Record lock, heap no 4 PHYSICAL RECORD: n_fields 6; compact format; info bits 0
     0: len 4; hex 80000006; asc     ;;
     1: len 6; hex 0000000c56af; asc     V ;;
     2: len 7; hex 7b000001ea0fdc; asc {      ;;
     3: len 4; hex 80000006; asc     ;;
     4: len 4; hex 80000006; asc     ;;
     5: len 4; hex 80000006; asc     ;;
    

    这就是unlock row的核心作用,但是实际上每行都加过锁,只是不符合where条件的记录的被unlock 掉了,下文描述。继续做一个操作如下:

    session2:
    mysql> begin;
    Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)
    mysql> select * from testsemi30 where c=4 for update;
    此处堵塞,row lock如下:
    TABLE LOCK table `test`.`testsemi30` trx id 808624 lock mode IX
    RECORD LOCKS space id 9694 page no 3 n bits 72 index PRIMARY of table `test`.`testsemi30` trx id 808624 lock_mode X(LOCK_X) locks rec but not gap(LOCK_REC_NOT_GAP)
    Record lock, heap no 3 PHYSICAL RECORD: n_fields 6; compact format; info bits 0
     0: len 4; hex 80000004; asc     ;;
     1: len 6; hex 0000000c5687; asc     V ;;
     2: len 7; hex e200000089011d; asc        ;;
     3: len 4; hex 80000004; asc     ;;
     4: len 4; hex 80000004; asc     ;;
     5: len 4; hex 80000004; asc     ;;
    
    RECORD LOCKS space id 9694 page no 3 n bits 72 index PRIMARY of table `test`.`testsemi30` trx id 808624 lock_mode X(LOCK_X) locks rec but not gap(LOCK_REC_NOT_GAP) waiting(LOCK_WAIT)
    Record lock, heap no 4 PHYSICAL RECORD: n_fields 6; compact format; info bits 0
     0: len 4; hex 80000006; asc     ;;
     1: len 6; hex 0000000c56af; asc     V ;;
     2: len 7; hex 7b000001ea0fdc; asc {      ;;
     3: len 4; hex 80000006; asc     ;;
     4: len 4; hex 80000006; asc     ;;
     5: len 4; hex 80000006; asc     ;;
    

    这是因为这个语句虽然会触发unlock row,但是当加锁在primary id a=6 这一行的时候被session 1堵塞掉了,因为session 1经过unlock row特性优化后还是持有primary id a=6的这行记录的锁,当然select语句不存在semi update一说。

    3.1.2 例子2:

    如果将上面session 2的select for update语句换为update语句就不同了如下:

    mysql> begin;
    Query OK, 0 rows affected (0.00 sec)
    mysql> update testsemi30 set d=4 where c=4;
    Query OK, 1 row affected (0.00 sec)
    Rows matched: 1  Changed: 1  Warnings: 0
    这个语句是可以完成。事务上锁如下:
    ---TRANSACTION 808627, ACTIVE 4 sec
    2 lock struct(s), heap size 1160, 2 row lock(s), undo log entries 1
    MySQL thread id 18, OS thread handle 140735862867712, query id 363 localhost root
    TABLE LOCK table `test`.`testsemi30` trx id 808627 lock mode IX
    RECORD LOCKS space id 9694 page no 3 n bits 72 index PRIMARY of table `test`.`testsemi30` trx id 808627 lock_mode X(LOCK_X) locks rec but not gap(LOCK_REC_NOT_GAP)
    Record lock, heap no 3 PHYSICAL RECORD: n_fields 6; compact format; info bits 0
     0: len 4; hex 80000004; asc     ;;
     1: len 6; hex 0000000c56b3; asc     V ;;
     2: len 7; hex 7e000001da1d79; asc ~     y;;
     3: len 4; hex 80000004; asc     ;;
     4: len 4; hex 80000004; asc     ;;
     5: len 4; hex 80000004; asc     ;;
    

    这实际上就是semi update的核心理念,它能够让本应该堵塞的update语句继续执行,即便session 1持有primary id a=6的这行记录的锁,也可以继续。

    3.2 unlock row

    就是例子1中的测试

    1、Update访问一条数据,innodb层获取row lock。
    2、MySQL层根据where条件,如果是不需要的行,则直接unlock掉,这个操作的核心函数就是ha_innobase::unlock_row

    而在Update上,我们也很容看到这种比较和过滤,下面是MySQL 过滤where条件的行

    mysql_update:
     if ((!qep_tab.skip_record(thd, &skip_record) && !skip_record)) //跳过操作 是否符合查询条件
    table->file->unlock_row(); //如果是where条件过滤的直接跳到解锁这步
    
    对比比较我们可以直接debug整数的比较函数如下:
    #0  Item_func_eq::val_int (this=0x7fff2800ad28) at /opt/percona-server-locks-detail-5.7.22/sql/item_cmpfunc.cc:2506
    #1  0x0000000000f4a17b in QEP_TAB::skip_record (this=0x7fff9f1cdf78, thd=0x7fff28012cc0, skip_record_arg=0x7fff9f1ce0fe) at /opt/percona-server-locks-detail-5.7.22/sql/sql_executor.h:457
    #2  0x0000000001626efa in mysql_update (thd=0x7fff28012cc0, fields=..., values=..., limit=18446744073709551615, handle_duplicates=DUP_ERROR, found_return=0x7fff9f1ce268, 
        updated_return=0x7fff9f1ce260) at /opt/percona-server-locks-detail-5.7.22/sql/sql_update.cc:816
    这个地方可以看到两个比较的值
    (gdb) p val1
    $12 = 2
    (gdb) p val2
    $13 = 2
    

    另外在ha_innobase::unlock_row函数中为了适配semi update,也做了相应的逻辑如下,

        switch (m_prebuilt->row_read_type) {
        case ROW_READ_WITH_LOCKS: //如果是加锁了
            if (!srv_locks_unsafe_for_binlog //判定隔离级别为RC才做解锁
                && m_prebuilt->trx->isolation_level
                > TRX_ISO_READ_COMMITTED) {
                break;
            }
            /* fall through */
        case ROW_READ_TRY_SEMI_CONSISTENT://如果semi update,TRY_SEMI才进行解锁
            row_unlock_for_mysql(m_prebuilt, FALSE);  mysql_update
            break;
        case ROW_READ_DID_SEMI_CONSISTENT://如果semi update,为DID_SEMI那么就不做了,因为没有锁可以解了,semi update 已经在引擎层解掉了
            m_prebuilt->row_read_type = ROW_READ_TRY_SEMI_CONSISTENT;
            break;
        }
    

    这是因为对于semi update遇到row lock堵塞的时候直接就在堵塞后直接解锁了,不需要回到MySQL层解锁(如下文所述)。那么这个特性两个重要影响就是如下:

    • 每行row lock加锁是不可避免的,但是会在MySQL层判定后解锁,那么最终这个事务加锁的记录就会很少,这会提高业务的并发,这一点是非常重要的,这种情况下show engine 最终看到的row lock 锁信息就很少了。
    • 但是频繁的lock/unlock rec导致LOCK_SYS这个mutex很容易成为热点mutex。

    我们可以简单看一下unlock rec的函数lock_rec_unlock,这个函数一上来就可能看到加锁LOCK_SYS,然后通过hash算法,在lock_sys_t中找到对用cell的头节点,然后遍历找到相应的block对应的lock_t结构,然后调用lock_rec_reset_nth_bit函数,解锁相应的位图结构(row lock所在的位置)。

    3.3 semi update

    就是例子2中的测试,这个特性一定要在出现了row lock堵塞后才会进行判定,是innodb层直接就解除了堵塞,如下,

    1、Update 修改一行数据之前设置标记ROW_READ_TRY_SEMI_CONSISTENT
    2、访问一行数据,innodb层尝试获取row lock,如果被堵塞则触发semi update判定,判定的规则包含

    • 不能为唯一性扫描(unique_search)
    • 必须为主键(index != clust_index)
    • 不能产生死锁(Check whether it was a deadlock or not)
    • RC隔离级别或者innodb_locks_unsafe_for_binlog参数设置了(8.0移除了本参数)
    • update语句才可以

    主键的非唯一性扫描,最常见的就是全表扫描了。

    3、访问本行修改前的old rec 记录(row_sel_build_committed_vers_for_mysql),并且解除堵塞(lock_cancel_waiting_and_release),解除的时候,会将事务wait_lock设置为NULL,同时从 trx_lock中移除,lock_sys_t中的hash结构也会清除掉。 实际上lock_cancel_waiting_and_release就是本特性的核心函数。及如下:

    lock_cancel_waiting_and_release
       ->lock_rec_dequeue_from_page //lock_sys_t中的hash结构会清除,trx_lock中移除
       ->lock_reset_lock_and_trx_wait //wait_lock设置为NULL
     
    

    4、返回old rec给mysql层,并且设置变量did_semi_consistent_read=true(导致设置标记ROW_READ_DID_SEMI_CONSISTENT)
    5、判定是否满足where条件,如果不满足就扫描下一行了,如果满足再次进入innodb层进入堵塞状态,这个时候ROW_READ_DID_SEMI_CONSISTENT标记已经设置不会再做semi update的判定了,同时如上文如果ROW_READ_DID_SEMI_CONSISTENT标记设置了就不会真正触发unlock row操作。

    和unlock row特性不同,unlock row 围绕的核心是让整个语句执行完成后加锁的行更少,而semi update 围绕的核心是出现了堵塞后update语句(触发了全表扫描)是否能够继续,这是非常重要的不同点。

    四、额外的问题

    分析到这里,我们知道了本案例中是由于没有使用到索引进行update语句出现了大量的lock rec和unlock rec 导致lock_sys_t 结构的mutex LOCK_SYS出现了热点锁,但是还有一个奇怪的问题如下:

    image.png

    注意到这里的row lock和lock struct 都是比较多的,为什么会这样呢,经过unlock row和semi update过后锁定的行数应该是只有1行。
    为了更方便的讨论这部分,我们将涉及到的数据结构的元素画个简单的图,同时讲上面提到的lock_sys_t涉及的hash结构也画一下,需要注意的是这些数据结构元素很多很多,这里只话了和问题相关的部分,涉及得很少。


    image.png

    这里需要注意几点:

    • 对于这个rec_hash这个hash查找表的hash值来自于space_id和page_no
    • lock_t是所谓的lock struct,相关的属性比如LOCK_X|LOCK_S,还有LOCK_REC_NOT_GAP/LOCK_REC_GAP 等都是它的属性,而不是某行记录的属性。
    • 一个lock_t的bit map最多能够容纳下一个page的所有行的加锁情况。
    • bit map才是实际的加锁的体现,它附着在每一个lock_t结构上,innodb通过lock_t[1]快速的找到了他的位置,然后进行设置,在函数lock_rec_reset_nth_bit可以看到这种操作如下:
    reinterpret_cast<byte*>(&lock[1])
    

    好了回到上面的问题, row locks和lock struct这两个输出,实际上来自如下:

    • row locks:trx->lock->n_rec_locks 这个值是trx_lock_t上的一个统计值而已,在每个调用函数lock_rec_reset_nth_bit和lock_rec_set_nth_bit的末尾减少和增加,对应是解锁和加锁某一行操作。
    • lock struct: UT_LIST_GET_LEN(trx->lock.trx_locks) 这个值实际上就是上面我们看到的链表的长度,应该来说是比较准确的。

    那么,虽然unlock row 释放了rec lock也就是设置了其标记的bit位,但是lock_t结构本身没有释放,所以lock struct多也可以理解,但是因为上锁和解锁通常要遍历整个page所在lock_sys_t的cell链表上的所有lock struct,如果lock struct多那上LOCK_SYS mutex持有的时间就更长,也符合我们本次问题由于没有用到索引,且并发执行大量的update导致的LOCK_SY mutex的spin。

    但是row locks看起来就不那么准确了,随后我做了一个测试,只做了少量的行,触发了一次semi update,看到了结果也是2 row lock,如下:

    表结构和数据:
    mysql> show create table testsemi40 \G
    *************************** 1. row ***************************
           Table: testsemi40
    Create Table: CREATE TABLE `testsemi40` (
      `a` int(11) NOT NULL AUTO_INCREMENT,
      `b` int(11) DEFAULT NULL,
      `c` int(11) DEFAULT NULL,
      `d` int(11) NOT NULL,
      PRIMARY KEY (`a`),
      KEY `b` (`b`,`c`)
    ) ENGINE=InnoDB AUTO_INCREMENT=7 DEFAULT CHARSET=utf8mb4 COLLATE=utf8mb4_unicode_ci
    mysql> select *from testsemi40;
    +---+------+------+----+
    | a | b    | c    | d  |
    +---+------+------+----+
    | 2 |    2 |    2 | 0 |
    | 4 |    4 |    4 | 0 |
    | 6 |    6 |    6 | 0 |
    +---+------+------+----+
    3 rows in set (0.00 sec)
    session 1:
    mysql> begin;
    Query OK, 0 rows affected (0.10 sec)
    mysql> update testsemi40 set d=6 where c=6;
    Query OK, 1 row affected (0.00 sec)
    Rows matched: 1  Changed: 1  Warnings: 0
    
    session2:
    mysql> begin;
    Query OK, 0 rows affected (0.10 sec)
    mysql> update testsemi40 set d=2 where c=2;
    Query OK, 1 row affected (0.01 sec)
    Rows matched: 1  Changed: 1  Warnings: 0
    
    show engine信息,session2上锁的信息如下:
    ---TRANSACTION 808633, ACTIVE 4 sec
    2 lock struct(s), heap size 1160, 2 row lock(s), undo log entries 1 (这里有2 row locks)
    MySQL thread id 18, OS thread handle 140735862867712, query id 381 localhost root
    TABLE LOCK table `test`.`testsemi40` trx id 808633 lock mode IX
    RECORD LOCKS space id 9695 page no 3 n bits 72 index PRIMARY of table `test`.`testsemi40` trx id 808633 lock_mode X(LOCK_X) locks rec but not gap(LOCK_REC_NOT_GAP)
    Record lock, heap no 2 PHYSICAL RECORD: n_fields 6; compact format; info bits 0
     0: len 4; hex 80000002; asc     ;;
     1: len 6; hex 0000000c56b9; asc     V ;;
     2: len 7; hex 21000001ec2701; asc !    ' ;;
     3: len 4; hex 80000002; asc     ;;
     4: len 4; hex 80000002; asc     ;;
     5: len 4; hex 80000002; asc     ;;
    

    但是我顺着show engine打印本事务的每个lock_t中的bit map加锁结构发下如下:

    断点:lock_rec_print 
    大体输出流程如下:
    lock_print_info_all_transactions
    循环输出所有的事务的信息 
     ->lock_trx_print_locks 
        循环输出当前事务的所有lock_t 行锁信息
        ->lock_rec_print 
          循环lock_t的位图信息,打印出详细的加锁行
    
    我们只需要在lock_rec_print 函数中通过如下输出
    (gdb) p (&lock[1])
    $21 = (const ib_lock_t *) 0x2fd79c0
    (gdb) x/8bx 0x2fd79c0
    0x2fd79c0:      0x04    0x00    0x00    0x00    0x00    0x00    0x00    0x00
    打印所有的lock_t结构就可以了
    

    实际上这里只有一个实际上就只有1个lock_t(当然是rec_lock,不讨论table_lock)结构,看到的加锁信息就是0x04,转二进制就是100,显然就是1行加锁了嘛,对应的heap no 2这一行, heap no 0和heap no 1是innodb的page里面的2个伪列。工具blockinfo输出可以确认如下:

    (1) INFIMUM record offset:99 heapno:0 n_owned 1,delflag:N minflag:0 rectype:2
    (2) normal record offset:126 heapno:2 n_owned 0,delflag:N minflag:0 rectype:0
    (3) SUPREMUM record offset:112 heapno:1 n_owned 5,delflag:N minflag:0 rectype:3
    

    这样我们就确认了在semi update的方式下,row locks的这个计数器统计应该是出现问题的,有什么情况下不会调用lock_rec_reset_nth_bit函数来减少这个计数器呢?

    实际这个问题就出现在semi update的核心函数lock_cancel_waiting_and_release上,解除等待时候是将整体lock_t结构给抹掉了,而MySQL层又不会调用unlock row,因为lock_t结构都没有了,也就是核心减少计数器的函数lock_rec_reset_nth_bit并没有调用。因此这个trx->lock->n_rec_locks 计数器在semi update触发的情况下只增加了没减少。言外之意就是semi update在高并发下发生的次数越多,row locks的计数就越不准确。
    那么稍微修改一下代码验证一下(仅为验证这种场景,这种修改可能并不可取),我使用在8.0.23上做了同样测试结果一致,同时在8.0.23代码上做的修改,增加2行如下:

    void lock_reset_lock_and_trx_wait(lock_t *lock) /*!< in/out: record lock */
    {
    ...
      @see trx_lock_t::wait_lock_type for more detailed explanation. */
      lock->type_mode &= ~LOCK_WAIT; 
      ut_ad(lock->trx->lock.n_rec_locks.load() > 0); //增加
      lock->trx->lock.n_rec_locks.fetch_sub(1, std::memory_order_relaxed);  //增加
    
    

    然后我们使用前面的方式继续测试发现得到row lock值已经准确了如下:

    ---TRANSACTION 2740515, ACTIVE 6 sec
    2 lock struct(s), heap size 1200, 1 row lock(s), undo log entries 1 (这里显示正确了)
    MySQL thread id 9, OS thread handle 140736352634624, query id 36 localhost root starting
    show engine innodb status
    ---TRANSACTION 2740513, ACTIVE 54 sec
    2 lock struct(s), heap size 1200, 1 row lock(s), undo log entries 1
    MySQL thread id 8, OS thread handle 140736353167104, query id 21 localhost root
    

    当然这么改可能是不合适的,因为这个函数调用者还很多,这里只是修改后验证一下这个猜想。确实这种情况容易导致DBA误判,实际上row lock 并没有row locks统计出来的那么多,随后给官方提交下BUG看看。

    最后

    这个问题处理起来还是比较简单,但是背后还是有很多可以深挖的地方,本文主要使用的代码是5.7.22,对于semi update下row locks不准的情况在8.0.28 也测试了,依旧存在这个问题。另外在8.0中热点锁LOCK_SYS视乎做了拆分,也许情况会好一些,随后也可以学习下这部分内容,看看官方如何拆锁的。

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          本文标题:MySQL:Update语句高并发下变慢的案例及其涉及的知识

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