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2021-08-04:GO富集网络可视化工具

2021-08-04:GO富集网络可视化工具

作者: wangyantao1991 | 来源:发表于2021-08-06 16:30 被阅读0次

利用Cytoscape上的插件可以实现GO 分析的网络化,不过非模式植物会很麻烦:具体参考了简书的以下内容:

Bingo(Cytoscape插件)GO功能富集分析 - 简书 (jianshu.com)

之前拿到了GOlist,只不过需要删除中间的tab+GO: 

使用sed ‘s/\tGO:/ = /g' 进行编辑,这个格式的注释文件需要注意,在注释文件的首行需要添加一段文字:

(species=sss_aa)(type=Consortium)(curator=GO)

首行加上上述文字后就能被识别了。

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