通过上一步的安装，我们了解到InVEST模型有多个模块，每一个模块在说明文档中都有详细的介绍。下面主要介绍，如何打开运行InVEST，了解它的输入输出和操作流程。
1. InVEST模型原理简介
InVEST模型采用生产函数的方法来量化和评估生态系统服务。生产功能详细说明了在相应的条件和过程下，环境提供的生态系统服务的输出。一旦指定了生产函数，我们可以量化其对土地变化的影响、或者是水体变化对生态系统服务输出的水平的影响。
InVEST使用了一种简单的框架，它描绘了―供应、服务和价，将生产功能和提供给人们的福利联系了起来，如下图所示。供应指的是生态系统中的哪些内容是潜在可用的（即：生态系统的结构和功能可以提供什么）。例如，特定位置和密度的红树林对陆上的侵蚀和洪水的削减。服务结合了需求，从而使用该服务的受益者（例如，人们在哪里生活、重要的文化场所、基础设施等）的信息。价值括了社会偏好，同时允许计算经济和社会的指标（例如，预防侵蚀和洪水损害的情况、被影响的人数）。
模型的供应、服务和益处
根据利益相关者的协商和情景开发，InVEST可以估算为当前或在未来情景下提供的生态系统服务的数量和价值。 简而言之是明确需求--设定场景--模型评估-再次服务决策的这么一个过程。如下图所示。
InVEST使用方法
InVEST的使用源于与一系列的利益相关者协商。通过讨论，可以确定政策制定者、团体和保护组织的利益问题。这些问题可能涉及到当前的服务提供、以及未来新的方案、政策和条件将如何影响这些服务。对于未来的问题，利益相关者会开发―方来探索自然资源的预期变化的后果。这些情况通常包括未来的土地利用和土地覆盖图、或者是海洋模型图、未来的沿海和海洋用途和沿海/海洋生境图。生物物理和经济模型会对这些方案的生态系统服务价值进行评估，而生物物理和经济模型可以生成几种类型的输出。
InVEST模型在空间上是明确的，它将使用地图作为信息来源，并生成地图作为输出。InVEST的返回内容可以是生物物理方面，包括绝对数量或相对幅度（例如，泥沙持留的吨数或泥沙持留的变化百分比），也可以是经济价值（例如，可以避免的、由输沙量的改变导致的水处理成本的变化）。分析的空间范围也比较灵活，允许用户解决本地、区域或全球范围内的问题。InVEST的结果可以与利益相关者和决策者分享，这些人创建了情景，以便了解将来决策的效果。InVEST的使用是一个迭代过程，利益相关者可以根据模型所揭示的信息，选择创建新的方案，直到确定合适的管理方案
2. 生境质量模块操作过程
0. 模块所需数据简介
以生物多样性模块为例，下图是生物多样性模块（也叫生境质量）所需要的的输入数据，操作过程，和输出结果。
模块数据输入要求和输出
其他模块的数据输入要求可以看参考文档的总表格，详细的需要干下面这件事情。
1. 详细阅读模块内容
这一步很重要，把模块的内容详细阅读了，就大概率明白了这块的东西，也更清楚了模型的输入和输出数据，哪些是必选的，以及为什么要选择它们。花费半个小时，即可概略了解感兴趣的模块。
模块阅读
2. 运行模型（示例数据）
在开始菜单中找到InVEST文件夹，点击Habitat Quality（即生境质量模块），即可运行模型，模型界面如下。（一开始会没有反应，稍等一下新界面就跳出来了）
模型界面
按照官网文档，需要检查输入数据（数值正确，无缺失数据，同一个投影坐标等）等等，可以参见https://storage.googleapis.com/releases.naturalcapitalproject.org/invest-userguide/latest/getting_started.html#running-models
现在针对界面上的每一个必填项，把相应的数据拖进去，或者点击文件夹选中对应的数据。填完之后点击运行。这个时候如果不懂要填的内容的含义，可以点击右侧的information图标，或者再返回模块的说明文档。
点击运行
运行结果-没有修改输出空间-_-
运行后，输入文件内容如下。其中output是后缀名。
- Parameter log， 每次模型运行的参数记录文件
- deg_sum_c_output，当前景观类型的相对生境退化水平。1代表退化度高，0代表退化度低。非生境的栅格（LULC，Hj=0）退化得分值为0。
- quality_c_output，当前景观类型的生境质量。较高数值表示较好的生境质量。非生境的景观区域生境得分值为0。质量得分值无量纲，不能反映特定的生物多样性测量。
- rarity_c_output，当前景观类型的相对生境稀有性。该输出只在具备基准LULC地图(输入 # 3) 才能生成。值越接近1代表该生境类型越稀有。
因为模型输入了未来的情景，所以结果中带有f的文件表示未来景观的三种指标。在QGIS环境下，打开结果如下图所示。
栅格结果
后续可以在此栅格的基础上进行分区统计等分析。
3. 操作后的感悟
整体来看，模型或者说具体模型的使用还是简单的，但是重点在于对内部机理的理解。输入数据的整理和规范化也是一块耗时费力的事情。
总而言之，针对感兴趣的模块，需要先把用户手册读懂了（只读对应模块和前言就行），然后再去搜搜文献，看看别人的用法，就会加深这块的了解。当然了，上手实践才是最重要的。
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