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博士后前一个半月的总结

博士后前一个半月的总结

作者: 傅小潇 | 来源:发表于2018-11-01 13:58 被阅读16次

来Snyder lab有一个半月了,简单总结下这一个半月里面做了什么,然后再列举一下接下来一个月要做的主要事情。

主要做了的事情:

  1. 熟悉了组里面大家现在在做什么课题,看了组里面近期发表的主要文章
  2. 看了科研修炼手册,从设计课题的角度,学习了做课题时候的一些套路,以及现在生物医学领域有哪一些topic做的人比较多
  3. 重新学习几个常用的机器学习的方法,包括:
  • Linear regression
  • Logistic regression
  • Lasso
  • Ridge regression
  • Decision tree
  • Random forest
  • Artificial neuron network
  1. 更加深入学习了ATAC-Seq analysis pipeline,并正在更加深入学习RNA-Seq analysis pipeline,目的是能够全面了解现在最优的分析工具,减少做这些数据时候的分析时间,并且深入了解每一步分析是如何做的,如何评估一个测序数据的好坏。

  2. 确定了现在主要做的两三个课题

接下来一个月要做的:

  1. 建立自己的自动化的RNA-Seq analysis pipeline
  2. 建立自己的start-to-end的DNA methylation analysis pipeline
  3. 推进methylation课题的分析

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